规范化的吞咽障碍治疗涉及很多因素，在整体考虑中，这些因素的主次之分、先后顺序对治疗决策影响很大。对各种原因引起的吞咽障碍，在制定临床治疗决策中，两个重要因素必须考虑：呼吸道保护；营养与脱水。

1.呼吸道保护：进食的安全性常与呼吸道保护联系在一起。当患者误吸过多的液体或食团常会导致呼吸道感染危险增加，有时会因为吞咽固体食物而导致呼吸道梗阻，有关的评估和治疗将不再安全。

2.营养与脱水：足量的营养是保证体质和治疗的前提，要考虑患者是否可以经口进食足够能量，是否有能力消化、吸收足够能量来维持营养和防止脱水。

3.个体化：每个患者吞咽障碍的侧重点都是不同的，针对不同的患者治疗方案也应个体化。

4.注意事项：在制定治疗目标时，对患者目前的状况及影响因素和未来可以达到的程度应有清楚的了解。

如果患者不能经口进食，临床治疗重点应放在设法挖掘患者恢复经口进食的潜能上，或者改变进食方式（鼻饲、胃造瘘）为吞咽治疗提供时机；如果患者可以完成经口进食，治疗重点应放在增加摄入量来维持营养，或为拓宽进食的种类，改善生活质量和适应社会交际需要上。